@makoto2 さん、ご質問ありがとうございます。 現在のところ無効にする方法はないと思います。
英語版では、キーボードショートカットをカスタマイズできるようにしてほしいとの提案が挙がっていますが、無効にする提案はないようです。
よろしければ 製品フィードバック でリクエストしていただけたら幸いです。 また、普段あまり vim を使わないのでよくわからないのですが、使用できないのは修飾キーのない受信トレイのショートカットでしょうか？それとも、全体的に問題が起きていますか？